在事业单位的工资组成中，绩效工资占主要部分，占比能达到80%左右，事业单位待遇高低主要看绩效工资水平，而不同的单位绩效工资组成、增长率和分配方式有所不同。

一般而言，绩效工资由固定绩效、奖励性绩效、季度考核绩效、年度考核绩效等部分组成。固定绩效可分为职称职级绩效和累计贡献绩效两部分，主要与职称、工龄相关。奖励性绩效、季度考核绩效和年度考核绩效则跟个人的工作业绩和考核结果相关，事业单位也会对工作人员实行考核，主要考察工作人员的工作实绩。但部分单位仍存在吃"大锅饭"，干好干坏绩效工资水平一样的弊病。

对于一个单位而言，绩效工资总额每年在增长，增长率由上级部门进行核定，核定依据是单位整体工作表现和考核结果，事业单位只能在核定的绩效工资总额内发放绩效工资，即每年的"蛋糕"大小是固定的。

在具体发放方式上，部分单位在平常每个月就将绩效工资按照100%的比例进行发放，到年底时，绩效工资总量发放完毕，这部分单位就无年度考核绩效。部分单位则在平常只发放部分绩效工资，剩余部分等到年终考核时，以年度考核绩效方式发放。